Magicfolder／MagicfolderPlusは、サービスとして動作するアプリケーションです。
初期設定では、「ローカル システム アカウント」にてサービスが実行されます。

「ローカル システム アカウント」は、導入環境内のファイル操作には対応していますが、ネットワーク上のフォルダに対するアクセス権限（接続および読み書き権限）を持っていません。
そのため、Magicfolderでネットワーク上のフォルダにアクセスする場合は、該当フォルダへのアクセス権限を持つアカウントを、サービスの実行アカウントとして設定する必要があります。
また、ネットワーク上のフォルダがドメインユーザーによるアクセスを前提としている場合は、サービスの実行アカウントも同一ドメイン上のユーザーに設定してください。

なお、Magicfolderの導入環境がドメインに参加していない場合は、Windowsの「サービス」機能において、ドメインユーザーをサービスの実行アカウントとして指定することはできません。
これは、ドメインに参加していない環境では、ドメインユーザーの認識が行えず、ユーザーを指定できないためです。

そのため、ネットワーク上のフォルダがドメインユーザーによるアクセスを前提としている場合は、Magicfolderの導入環境をドメインに参加させてください。