Create!Formは、1度の実行で作成できるPDFファイルは1つになります。
そのため、複数のPDFを作成するには、予め、CSVファイルをキー単位に分割しておき、分割したファイルに対してそれぞれ実行を行う必要があります。

なお、Magicfolder/MagicfolderPlusであれば、[ファイル分割]機能が用意してありますので、自動でCSVをキー単位にファイルを分割し、それぞれのファイルに対してPDFを作成することが可能となります。